发酵中药的生理功能主要有以下几个方面：

增加药物疗效：发酵可以使中药中的有效成分转化为更活跃、更稳定的形式，以增加药物的疗效。例如，发酵可以使一些中药中的酚类物质转变为配糖体或酯类，提高药物的溶解度和稳定性，从而增强其药效。

增强药物吸收：发酵可以改变中药的结构和性质，提高其溶解度和可溶性，从而增强药物在体内的吸收。例如，发酵可以使一些中药中的大分子化合物降解为小分子物质，有利于通过肠道吸收。

降低中毒风险：一些中药在原始状态下可能含有一定的毒性成分，经过发酵可以降低其毒性，提高安全性。发酵过程中，一些毒性物质可能被代谢或转化为非毒性物质，或者在发酵基质中被稀释，减少其毒性。

提高药物稳定性：发酵过程可以产生酸、醇、酶等物质，具有抑菌、抗氧化等作用，可以提高中药的稳定性和保存时间。同时，一些有害物质通过发酵可以被降解或转化，减少药物的变质和质量损失。

总之，发酵中药可以改善药物的药效、吸收、安全性和稳定性，提高其疗效和临床效果。但需要注意的是，不同中药在发酵过程中的效果与方法可能存在差异，应根据具体情况进行研究和应用。